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LCMSMS和LCMS定量分析 的幾個問題
質(zhì)譜定量中已經(jīng)被廣泛接受的方式是MS/MS定量。這種定量常通過三級四極桿或離子阱質(zhì)譜實現(xiàn)。要求使用MS/MS的原因是：許多化合物有同樣的質(zhì)量。當(dāng)使用Di一個維度即單級質(zhì)譜MS去定量時，也會缺乏特異性，尤其是對于像血液那樣的復(fù)雜的基質(zhì)。Di二個維度的MS（即MS/MS）在大多數(shù)情況下，能夠提供wei一的斷裂。合并特異的母離子質(zhì)量和wei一的碎片離子信息，可以選擇性地監(jiān)測被定量的化合物。
LCMSMS定量分析實例
Q：我想用LC-Q-TOF-MS 來做代謝組學(xué)，因為是樣品是體液含有多種化合物，想加入內(nèi)標(biāo)后先進行一個相對的定量來判斷含量發(fā)生變化的化合物，怎樣去定量？用總離子流圖好像不合適，如果利用峰面積進行相對定量的話，用哪個圖比較合適？得用標(biāo)準(zhǔn)品才能定性嗎？
LCMSMS定量分析使用SIM 或MRM模式。公認(rèn)的MRM更為準(zhǔn)確。SIM使用Q選擇性的濾過選中的分子量。但是分子量相同的化合物很多，所以，如果樣品稍微復(fù)雜的話，SIM基本不合適。
MRM選擇母離子和子離子。使用Q過濾母離子，q 轟擊母離子，TOF過濾子離子，使子離子被檢測器檢測到。分子量相同，轟擊后產(chǎn)生的子離子不一樣的干擾離子就被排除了。所以，MRM模式是更為可靠的LCMS定量分析方法。MRM檢測是離子對。
內(nèi)標(biāo)的選擇原理是結(jié)構(gòu)基本和待測化合物類似。結(jié)構(gòu)相同或類似，主要是為了滿足被離子化的效率與樣品類似。這就是為什么很多都選擇使用該化合物或此類化合物的氘代化合物。內(nèi)標(biāo)的選擇還要求其分子量與待測物質(zhì)不重合（還需要盡量避開化合物的isotopic peak的m/z），并且可以和待測物質(zhì)分開。
如果使用MRM, 樣品被分開的話，那么理論上來說總離子流圖上的每個峰都是代表一種物質(zhì)。同時使用MRM模式，如果樣品們的分子量與子離子不重疊，那么，即使在柱子中不被分開的化合物，也是可以認(rèn)為在MS中被分開了。
文獻報道的液質(zhì)中幾個峰，MRM檢測到幾十個物質(zhì)就是多個物質(zhì)在同一時間從色譜柱跑出來了。雖然出峰時間一樣，但是每個化合物的peak應(yīng)該是軟件中可以顯示出來的，只不過報道中由于篇幅有限，會被簡略掉。
定性的話，需要標(biāo)品，retention time 需要一致。
定量的話，需要先作標(biāo)準(zhǔn)曲線。peak area ration vs concentration.
